妖花については当方よく分からんので、pixiv大百科の記事をそこままコピヘしますね。堂々と手抜きですよ!w
>名称自体は不明だが、存在自体は人間界でも普通に知られている物であるで、本来は南方にしか存在せず、日本では育つはずのない植物であり、彼女自身から調査を依頼された鬼太郎は花から微かに漂う妖気と種を運ぶ風を頼りに大元である親株の場所を探し、自分を行かなければならない気がするという花子と共にかわうそ自慢の蛤船に乗って出航。
https://dic.pixiv.net/a/%E5%A6%96%E8%8A%B1
記事読んでる限りでは、妖花は鬼太郎が初出・水木氏による創作のようですね。直接現地で見聞きした伝承の可能性もありますが、少なくとも広くは知られていないようです。
それと戦争と結び付けた話が多いようで。
戦争経験をした水木氏の戦争が無くなって欲しいという願いが、平成霊和のアニメ鬼太郎にまで続いてると思うとムネアツですね。
雪風さんの説では幽霊は「肉体が滅んだ死んだ者の霊」ということで、大百科では
>妖花の正体は彼らの思いが花子を見守る為に咲かせた存在である
とあったから、霊そのものではないので幽霊と分けた場合でも妖怪になりますかね。
ただこれ6期の話だから、原作や他の時期のアニメとは異なるかも知れません。